Institut des agents infectieux

L'Institut des agents infectieux (Centre de Biologie Nord, Laboratoire de biologie médicale et de pathologie) héberge 4 centres nationaux de référence, experts dans la microbiologie des maladies infectieuses.

Centre national de référence enterovirus et parechovirus - Coordonateur

Le Centre National de Référence (CNR) des Entérovirus et Parechovirus a pour missions

1/ de contribuer à l’alerte en signalant à l’Institut national de Vieille Sanitaire (InVS) toute identification d’un poliovirus sauvage ou vaccinal, et toute apparition d’un entérovirus responsable de formes cliniques inhabituelles.

2/ de contribuer à la surveillance épidémiologique en lien avec l’InVS

en coordonnant le réseau de surveillance des entérovirus et en veillant à la représentativité des laboratoires correspondants.
en apportant à ce réseau un soutien pour l’aide et l’identification des entérovirus et parechovirus.
en contribuant à la surveillance internationale des entérovirus, en lien avec les organismes impliqués.

3/ d’apporter une expertise microbiologique permettant le développement et l’amélioration du diagnostic des infections à entérovirus et parechovirus et de leur identification.

Responsable : Pr Bruno LINA
Email : bruno.lina@chu-lyon.fr
http://cnr.chu-clermontferrand.fr/CNR/

Centre national de référence legionella - Coordonateur

Responsable : Dr Sophie JARRAUD
Email : sophie.jarraud@univ-lyon1.fr
http://cnr-legionelles.univ-lyon1.fr

Centre national de référence des staphylocoques - Coordonateur

Responsable : Pr François VANDENESCH
Email : francois.vandenesch@univ-lyon1.fr
http://cnr-staphylocoques.univ-lyon1.fr

Centre national de référence virus des infections respiratoires (dont la grippe) - Coordonateur

Responsable : Pr Bruno LINA
Email : bruno.lina@chu-lyon.fr
http://www.pasteur.fr/fr/sante/centres-nationaux-reference/les-cnr/virus-influenzae-grippe

Ressources

Covid

Bon de séquençage demande de covid :

BDM_HCL_v5.2.pdf664.14 Ko

Bon de demande de criblage Variants Covid-19 :

bdm_screeningcovid.pdf732.18 Ko

L’interprétation des antibiogrammes bactériens évolue en février 2022

Les changements impactent en particulier les molécules catégorisées « I ».
L’interprétation actuelle « I = intermédiaire », impliquant un succès thérapeutique incertain, est remplacée par l’interprétation « I = sensible à forte exposition », impliquant une forte probabilité de succès thérapeutique à condition que l’antibiotique soit administré à une posologie adaptée à l’espèce bactérienne. Plus d’explications dans la vidéo disponible sur ce lien.