Le centre spécialisé de l'obésité des Hospices Civils de Lyon est l'un des 5 centres français de référence pour l'obésité. Il regroupe des structures médicales et chirurgicales des HCL avec pour mission d'améliorer la prise en charge et la connaissance autour de l'obésité de l'adulte et de l'enfant.
Le service d'Endocrinologie-Diabète-Nutrition de l'hôpital Lyon Sud est spécialisé dans la prise en charge des maladies endocriniennes et métaboliques. Il intervient dans le traitement du diabète et de ses complications, de l'obésité, des pathologies thyroïdiennes, des insuffisances surrénaliennes et des pathologies hypophysaires.
Les chirurgiens du service de chirurgie endocrinienne sont experts dans la prise en charge des chirurgies des glandes thyroïdes, parathyroïdes, surrénales et du pancréas exocrine et endocrine.
Le service d’anesthésie-réanimation de l'hôpital Lyon Sud participe au service public de soins en hospitalisation programmée, en ambulatoire (le patient est hospitalisé le matin et sort le soir même après sa chirurgie), en urgence.