La maternité de type 2B (service de soins intensifs néonatals) de l'hôpital Lyon Sud assure le suivi et l'accouchement des grossesses simples ou présentant une anomalie.

Les chirurgiens du service de chirurgie endocrinienne sont experts dans la prise en charge des chirurgies des glandes thyroïdes, parathyroïdes, surrénales et du pancréas exocrine et endocrine.

Le centre du diabète DIAB-eCARE est un service des Hospices Civils de Lyon « hors les murs de l’hôpital ». Il s’agit d’une unité de soins ambulatoires dédiée aux adolescents et aux adultes porteurs d'un diabète et spécialisée dans le diabète de type 1.

Le CeGIDD de l'hôpital Edouard Herriot est l'un des centres HCL qui prend en charge le dépistage du VIH, des hépatites et des infections sexuellement transmissibles (IST). Il assure des consultations de dépistage, la prise en charge médicale des IST et des partenaires d’une personne dépistée positive.

Le centre d’addictologie de l'hôpital de la Croix-Rousse regroupe cinq offres de soins en addictologie axées sur une prise en charge pluridisciplinaire : médicale, infirmière, psychologique et sociale.

Le CeGIDD est le centre de dépistage du VIH, des hépatites et des infections sexuellement transmissibles (IST). Il assure des consultations de dépistage, la prise en charge des accidents d’expositions sexuelles au VIH, le traitement des IST et la prise en charge de la prophylaxie pré-exposition du VIH (PrEP).

Le Centre mémoire ressource recherche (CMRR) organise les cinq consultations « mémoire » du CHU, structure le parcours de soins pour le diagnostic, la prise en soins notamment pour les troubles du comportement, en collaboration avec les médecins de ville.

Le centre de médecine hyperbare, seul centre régional (16 places) assure les indications médicales de l’oxygénothérapie hyperbare.