Le service de médecine interne de l'hôpital Edouard Herriot prend en charge les patients atteints de pathologies auto-immunes systémiques, de maladies vasculaires artérielles ou veineuses, fréquentes ou rares.

Le service de cardiologie de Lyon Croix-Rousse pilote la Fédération de cardiologie Croix-Rousse / hôpital Lyon Sud, qui propose une filière unique de prise en charge sur les deux sites des HCL et un accès facilité à la plateforme interventionnelle du site de la Croix-Rousse.

Le service de médecine du vieillissement et cardiologie du sujet âgé de l'hôpital Edouard Herriot est dédié à la prise en charge des patients de 75 ans et plus présentant des affections aiguës, en particulier des pathologies cardiovasculaires.