- Centres experts cancers rares
- Centre de référence pour les épilepsies rares
- Centre du diabète Diab-ecare
- Centre de ressources et de compétences sclérose en plaques (CRC SEP)
- Centre de référence troubles spécifiques du langage et des apprentissages
- Centre référent pour l’anorexie et les troubles du comportement alimentaire de Lyon (CREATyon)
- Centre Intégré de l'Obésité
- Centre Mémoire de Ressources et Recherche
- Centre de référence des infections ostéo-articulaires complexes
- Cente de médecine hyperbare
- Centre d’évaluation et de traitement de la douleur
- Centre des brûlés de Lyon Pierre Colson
- Plateforme mouvement et handicap